杨过在从傻姑口中问出自己父亲是被郭靖夫妇所杀后感觉大受欺骗，在怒火的驱使下想为父报仇。杨过在告别陆无双与程英后于山岭间信步而行时无意中遇到了金轮法王师徒一行，在帮其疗伤后杨过要求国师帮自己报仇。
后来杨过在其点悟下武学修为更深了一层，并自创了四言诗剑法。又过了数日后，杨过在其的要求下迫于无奈前去见忽必烈。
金轮法王带杨过来蒙古大营见主帅忽必烈，并遇到其聘请来的潇湘子、尼摩星、尹克西等高手;之后众人见到周伯通无意中闯进并盗取了军旗意欲离开，在与其交手并夺回军旗后却不慎被其逃脱;最后在追捕过程中发现周伯通被一干穿着绿色及白色衣服拿着渔网且衣着奇特的人擒住，而众人皆因感到好奇而跟着他们去查看。
杨过与金轮法王一行众人来到绝情谷中，并受到谷主邀请而住下。次日杨过独自一人在谷中的后花园里信步而行时，遇到了谷主公孙止的女儿公孙绿萼。
经过一番闲谈说笑后，其对杨过大有好感。这时小龙女无意中出现，却想为了杨过好强忍着不与其相认;后来在谷主与小龙女举行的婚礼上因杨过对小龙女的真情流露，小龙女终和杨过相认。公孙止上前动手企图分开两人，便让他们去选剑来比武。而二人在剑室之中发现了君子、淑女两把利剑，并用此两把剑使出玉女素心剑法大战公孙止。
他们本可得胜但因小龙女前面被情花刺中又动了情而落败，杨过也因落败也被擒并带到内堂;而这时已经丧心病狂、贪恋小龙女美色的公孙止将千百朵情花刺于杨过之身，以此来要挟小龙女与己成亲才给解药。小龙女在迫于无奈下，只得答应公孙止的要求。随后因看到杨过极为痛苦，最后小龙女忍不住而扑到其身上也中了剧毒。
后来杨过和公孙绿萼齐齐中了公孙止的毒计落入鳄鱼潭，却在鳄鱼潭下面遇到了公孙绿萼的亲生母亲裘千尺。后来三人一同脱险，并在公孙止和小龙女举行成亲仪式时前来阻止。
杨过也即场把从裘千尺处得来的解药绝情丹给小龙女服下，并在裘千尺的帮助下打退公孙止;赶走公孙止之后由于杨过拒绝迎娶公孙绿鳄，在答应裘千尺去杀了郭靖、黄蓉后便和小龙女离开绝情谷。