虽然说火疗疗法具有简便易行，安全可靠，疗效显著等优点，但在操作火疗中仍然需要注意以下几点：
1、端正态度，互相配合
无论是康复科医师、还是火疗师，还是自己操作火疗，都要端正态度，认真操作，不可三心二意。患者要积极配合治疗，并通过掌握医理消除顾虑和恐惧，达到调理的目的。同时，还要努力提高火疗专业技术，保持体位、经脉穴位正确。
2、有序火疗，灵活掌握
火疗利用的是温热刺激，所以在实施中应遵循刺激程度由小到大的原则。权健博雅子老师指出：“凡火疗当先阴后阳，先上后下，先左后右”。
所以在操作中，宜先火疗上部穴位，后火疗下部穴位;先火疗头部穴位，后火疗四肢穴位;先火疗胸部穴位，后火疗背部穴位;先火疗阴经穴位，后火疗阳经穴位。就热度而言，宜先火疗轻，后火疗重。
但以上只是一般原则，对于经络未通，病情较重的患者，可先火疗大周天。总之，要做到原则和具体病情相结合，灵活掌握。
3、综合考虑，区别对待
一般来说，虚证患者身体虚弱，火疗可多些，实证患者机能亢进，火疗时间可少些，后以少渐多。
操作火疗时间和次数，冬季宜大于春秋，春秋宜大于夏季。根据患者及操作部位的承受能力，青壮年可多些，老人和小孩宜少些;背、腰、腹部可多些，四肢和胸部宜少些;头颈部和阴囊操作时间应更短，强度更小。
4、火疗禁忌，铭记于心
为避免不安全、不可控因素，醉酒、大怒、疲劳过度、空腹、过饱、严重口渴和受惊吓者不宜火疗。
颜面部、心区、大血管、肌腱和关节部不可局部操作;妇女在妊娠期或月经期，其腰骶部和少腹部不宜火疗。
5、提高警惕，避免晕火
由于火疗刺激过强，迷走神经反射，引起血管床扩张，外周血管阻力降低，最终导致心的回血量减少，从而表现出血压降低、眩晕等症状。
这种情况虽然并不常见，但也要提高警惕，一旦患者在接受火疗调理时出现头晕、眼花、恶心、心慌、多汗、面色苍白、手冷脉细、血压骤降以及晕倒等症，应备用白果酒两只，温热水一杯，让患者平卧，喝些水或者喝白果酒两只，即可消失。
6、注意操作火疗的时间
就火疗时间而言，上午、下午均可，一般阴晴天也不须避忌。失眠症可在临睡前火疗。
7、注意操作火疗的副反应
由于体质和病状不同，开始操作火疗可能引起发热、疲倦、口干、全身不适等反应，但一般不需顾虑，继续火疗即能消失。必要时可以延长间隔时间，如发生口渴、便秘、尿黄等症状，可以配合服用权健秘方产品，火疗的效果功效会大大的增加。
8、注意火疗部位的原则
凡火疗上胸部以后，最好配上后背部位加火疗，以引热通行。凡是全身性和内脏疾患，或做保健火疗，都是双侧互配火疗。局部病或一个肢体的病，只取局部或一侧的部位。当然，属于任、督二经的穴位自然是取单穴了。
9、火疗后有湿疹，妥善处理
操作火疗后，有一些人皮肤会出现湿疹，这是正常现象，不必惊慌。小范围湿疹可自行逐渐消失，大一些范围的可火疗后多涂火龙液，自然干后，再用薄膜覆盖，每日持续火疗，几日内自然消失。
10、姿势端正，体位舒适，手法精炼
凡火疗调法，体须平直，四肢勿使倾侧。火疗时莫慌乱，手法不正确，无益于事，徒破皮肉耳。若坐调、须则稳、操作火疗之，卧点则卧火疗之，之图而必火疗正统之，承专业之法，应该严格端正姿势，然后火疗
火疗胸腹应仰卧，腰及下肢后面应俯卧，肩背部要正坐或俯卧位，手足肘膝以下也以正坐为宜。尤其要注意体位自然，肌肉放松为主，不要取勉强的体位。
11、循序渐进，贵在坚持
火疗疗法是家庭常用的保健疗法，治疗时切忌三天打鱼，两天晒网，要持之以恒，才能见效。尤其是对于慢性虚证患者，更应该有足够的耐心，坚持火疗，收获健康。