李璮为什么会叛变这个问题在历史记载中并没有具体的说明，但是在后人的总结之中主要有以下几个原因导致了他的叛乱。首先要说到的是汉人的民族情结，当时的中国因为长时间受到汉人的统治，在思想上就是非常鄙夷其他种族的，忽必烈想改变这种根深蒂固的民族意识本身就是非常困难的，再加上他没有改变原有的统治方式，在他执政的两年中中国北方的一些人民对他的不满越来越严重，其中为首的就是李璮，这在某种意义上奠定了李璮叛变的基础。
李璮在统治山东益都地区时就积累了大量的兵力和财力，所以这个时候的忽必烈已经开始防备李璮，在李璮提出要忽必烈准许他越过淮河去骚扰南宋的时候忽必烈虽然赞赏他的想法但却没有授予他实质上的权利，这一点使李璮意识到忽必烈已经开始防备自己，1261年的时候李璮正式开始叛变，有人推测说他是得到了宋军的保证，也有可能是和南宋的贸易上他能取得更大的利益所以他才选择了背叛忽必烈。所以，综合上述几个可能性从而导致了李璮最后的叛变。
忽必烈在平定了李璮的叛乱后，他意识到自己要加强管理，否则内部还会出现类似于李璮叛乱的事情，而这些行为对国家稳定发展是十分不利的。忽必烈也意识到稳固自己政权的重要性，只要政权稳定，元朝才能朝更好的方向发展。这也是李璮叛乱对元朝的影响的最主要的一面。
忽必烈为了防止再次出现叛乱，于是便加强的统治，地方的军阀在知道李璮叛乱失败后，也都不敢做什么越权的事情，而是一心一意的辅佐忽必烈。与此同时，忽必烈对地方军阀的军队也进行了一番改革，忽必烈把地方世侯的军权进行了削减，这样便会避免再次出现内部叛乱的现象。在其他方面，忽必烈也是采取各种措施来削减世族的权利。忽必烈还下令不允许民间有造兵器的行为，诸侯世袭的政策也有所改变。总之忽必烈在李璮叛乱后，对国家的各个方面都进行了一番整治，主要目的就只有一个，加强皇权，削弱地方军阀的权利，这样才能使得国家更好的发展。
不过李璮叛乱对元朝的影响中也是有消极的，对元朝统治不利的一面的，那就是李璮叛乱造成一种分裂的局面。当然塞翁失马，焉知非福，当时的皇帝在经历了类似的叛乱事件后，对自己的政权会更加珍惜也更加用心的治理国家。于是在李璮叛乱后，忽必烈也采取了一系列改革措施，元朝又呈现出一片好景，社会十分安定，诸侯也都为忽必烈效力，使得元朝更加繁荣富强。