虽然包皮龟头炎的病原体较多而且发病复杂，但在实际临床中都会出现一些相似的症状。如包皮红肿、灼痛、排尿时加重、可有脓性分泌物自包皮口流出。如将包皮翻转，可见包皮内板和阴茎头充血、肿胀、重者可有浅小溃疡或糜烂，表现有脓液；或龟头起丘疹和红斑，逐渐扩大，边缘清楚，红斑上可见针头大小的小水疱，最后形成糜烂面；或龟头部起红斑丘疹、小水疱等。
包皮龟头炎根据病理表现和病原体等分类较多，但临床上包皮龟头炎主要根据不同的病原体进行分类，常见的病原体及所属的包皮龟头炎特点分述如下：
1、真菌性龟头炎。真菌性龟头包皮炎多是通过不洁性交被污染的，故被列为性传播性疾病之一。通过被污染有念珠菌的公共浴池、游泳池、浴巾、衣物、医疗器械、敷料等也可传染，或长期大量应用广谱抗生素，导致菌群失调而被感染（因为其为条件致病菌）。
2、念珠菌性包皮龟头炎。由念珠菌（霉菌的一种）引起，有原发、继发之分。继发一般发生于糖尿病或长期应用抗生素、皮质类固醇激素治疗后。此病可通过性交感染，患者配偶可有念珠菌性阴道炎。皮损以红斑为主，表面光滑，边缘轻度脱屑，红斑周围有丘疹或丘疱疹。有时糜烂，表面附着白色点状乳酪状分泌物。有异味，瘙痒。分泌物取材真菌镜检和培养可见念珠菌。
3、霉菌性龟头炎。霉菌性龟头炎，多好发于20～50岁之间的青壮年，由于青壮年皮脂腺分泌旺盛，外阴潮湿，加之穿较厚的内裤或外阴清洁不够，极易使散落在空气中或寄生在此处霉菌生根发芽，生出祸端，并可能传给配偶。许多中青年女性由于自身体质的变化，或服用了抗生素等药物，或过度洁癖，经常冲洗阴道，造成阴道内酸碱环境发生变化，正常相互牵制的寄生细菌失调，寄生在此处的真菌（霉菌）便乘虚而入，引起患者外阴及阴道发炎。房事后极有可能传给配偶，引起霉菌性龟头炎。