睾丸疼痛可大体上分为两种情况，急性的持续疼痛和慢性的经常性疼痛。
急性疼痛多见于睾丸炎和损伤。睾丸炎除血行感染外，更常见的是细菌经尿道逆行至附睾和睾丸，造成附睾炎、睾丸炎，临床可见附睾与睾丸肿胀和疼痛。睾丸损伤时有外伤史和局部的肿胀及瘀血。剧烈运动或房事、暴力有时可引起提睾肌的强烈收缩，从而使系带过长的睾丸发生扭转并引起睾丸的剧痛。由于睾丸扭转后阻断了睾丸的血液供应，所以睾丸除剧痛外并有阴囊肿大、皮肤水肿。相对来说，急性疼痛的诊断比较容易。
慢性疼痛时，轻者迁延日久。疼痛较轻、泛化、具有放射性疼，所以不容易判断炎症的确切部位。睾丸的疼痛不一定与炎症的轻重程度成正比，有些人的神经敏感程度很高，轻度炎症就可引起较严重的疼痛感；而有些人比较迟缓，自我感觉就轻。有的疼痛发生在性生活之后，这可能由于性兴奋使生殖器和生殖腺高度充血所致。有的疼痛系精索精脉曲张或其他部位的疼痛放射而来，如输尿管结石引起的睾丸放射性疼痛，这时就要仔细鉴别真正的原因以便有效的对症处理。
中医认为睾丸与肝经有着密切的关系，其疼痛与肝经受病有关。对于湿热下注的，治则以清热利湿，化浊止痛。对于寒湿凝滞型的治疗宜温肝散寒，化湿理气为法。气滞血瘀的治则以活血散瘀，行气止痛为法。对于脾肾亏虚的治疗治则以健脾益气，温阳补肾为主。