蜡笔小新：黑暗珠珠大追击

本作主角。因大家都將關心的視線投注在小寶寶小葵身上，感到相當吃味。某日散步途中，碰上了正在睡覺的玫瑰，並將遺落在旁彈珠帶了回家，卻被小葵誤食成了這次事件的開端。起初，因為廣志和美冴只會關心小葵，而變得自暴自棄，不過，故事後期被廣志的言詞說服，於是面對搶走妹妹小葵的珠黃泉族，才開始展現出做哥哥的自覺。

小新的雙親，普通上班族和家庭主婦。在小葵吞下彈珠後，便和珠由良三兄弟一同保護小葵的安全。由於他們是普通人，因此肉搏戰鮮少有活躍的演出；最終決戰時，美冴想出了以唱歌藉以讓腦袋空白，順利破解了海克森的讀心術。

小新的妹妹。本作為其劇場版初登場。前期時，誤吞了小新帶回家的彈珠，因此被珠黃泉族纏上（小新也曾在第1作《動感超人大戰高叉魔王》中誤吞動感石頭）。最後順利地排出了。

小新所飼養的狗。曾和眾人一同從珠由良根據地出發，卻在途中搭乘東北新幹線被遺忘在車上，直到最終決戰結束。尾聲時，自力走回春日部，片尾曲有和美冴、小葵一同洗澡的畫面。

由玫瑰、紫羅蘭、檸檬所組成的男大姐三兄弟。於繁華的新宿經營一間名為「甩甩蛋蛋 Swing Ball」的跨性別風俗店。雖然外表看起來像人妖，不過正因為是珠由良族，三人的功夫都相當高強。曾摸黑闖進野原家尋找彈珠，後得知為小葵所吞，為防止珠黃泉族的偷襲，決心保護珠珠和野原一家。曾中意廣志，全員皆戴耳環。
玫瑰（，鄉里大輔，台:曹冀魯）
　珠由良三兄弟的長男，本名「阿武」。有戀母情結。身形壯碩，鬍渣濃密，身穿粉色背心。始終和野原家一同行動。
　憤怒時會將語氣壓低，露出男性語調。睡覺怪癖為吸手指。喜好的男性類型為海克森。
紫羅蘭（，鹽澤兼人，台:魏伯勤）
　珠由良三兄弟的次男，本名「阿強」。穿著綠色旗袍為特徵。三人中容貌和姿態最接近女性的一人。主要和弟弟檸檬
　一同行動。故事中期，和檸檬對抗千瑪瑪一行人，慘遭擄為人質；不過，後期時偶然被東松山代子救出，與佐竹聯手擊退陪酒小姐軍團。後與海克森一戰亦參戰。
檸檬（，大瀧進矢，台:吳文民）
　珠由良三兄弟的三男，本名「阿剛」。身穿黃色功夫裝，厚嘴唇。具有靈力，曾以其能力看出小葵吞食珠珠的事實。
　曾稱美冴為「阿姨」。和紫羅蘭都於故事中期被抓為人質，尾聲則再度活躍。於健康中心時，大哥和二哥皆喝啤酒，喝果汁的檸檬被認為有未成年的可能性（或者秉持酒後不開車原則）。
在《蠟筆大戰》前篇，珠由良三兄弟曾與魔人賈克一同登場。

珠由良族的首領，亦為珠由良三兄弟的母親。是扛起一族之責的女好漢。討厭被玫瑰稱為「媽媽」，想要孫子。具有相當程度的靈力，能夠預知海克森的來襲，以及小葵的所在地。

本部電影女主角，千葉縣成田東西署的女刑警，個性大剌剌，不拘小節的年輕女性。崇拜動作片的英雄而成刑警，卻苦無讓她施展身手的案子（實際因素應為其技術太差），只能被分派到資料室做資料處理人員（而在其出門後，門上的「邪惡犯罪特別室」騙人貼紙才飄下）。配槍為貝瑞塔M92FS和貝瑞塔M84，雖為刑警，槍法卻是奇差無比，總是華麗連發的她卻絲毫不想承認。在廣志來不及搭車時，曾出手拉她卻反而摔落車下，一度只得在荒野中和廣志共同行動。曾說出因一些非現實的事情感到自暴自棄，而得到廣志的鼓勵（此橋段遭刪剪）。或許是因為在工作場所愛看空手道和摔角的雜誌，加上自主訓練，格鬥術實力甚強。因為現職刑警的緣故，有增強體力的習慣。希望別人忘了「代子」這名字，改叫她「蘿莉亞」。姓氏來源為埼玉縣東松山市。事件結束後，於片尾曲時受到警署表揚。

由勘兵衛（不明，台:魏伯勤）、勝四郎（中田雅之，台:吳文民）、七郎次（太田勝人，台:魏伯勤）、平八（中嶋聰彥，台:曹冀魯）、五郎兵衛（岩永哲哉，台:魏伯勤）、久蔵（不明，台:曹冀魯）、菊千代（納谷六朗，台:吳文民）所組成的珠由良族七戰士。雖然全員皆為老爺爺，功夫實力卻相當紮實。海克森向本部襲來時，全員出面迎戰，卻敗給了具有讀心術的海克森，紛紛遭到擊敗。名字來源為七武士。

珠黃泉族的御用保鑣，體格相當壯碩。苦無在玉王底下獲得升職的機會，原因在於上頭還有千瑪瑪和海克森的角力內戰。前身為反派職業摔角手，具有能衝破牆壁的驚人怪力，雖為摔角手卻相當在行「保母」一職，喜歡小孩，本性不壞。曾被千瑪瑪指出滿身汗味，立刻反駁每天都有洗澡。故事後半，在海克森將小葵帶回珠黃泉族本部後，因千瑪瑪討厭小孩，便由佐竹代為照顧。最後，正因其善良而背叛珠黃泉族，成了小新他們堅強的後援（另一原因應為，玉王始終不肯幫他加薪）。爾後以一人之力將陪酒小姐軍團擺平，但是在跟海克森一對一決鬥時被打得落花流水。事件結束後，片尾曲有被三兄弟收留成為店裡的服務生畫面。名字和角色設定來自佐竹雅昭。

珠黃泉族的副首領。率領來自玉王俱樂部的陪酒小姐軍團，全員皆擅長以如刀刃般鋒利的緞帶為武器的新體操格鬥術。穿著低胸連身裙，露出乳溝，強調其性感魅力的女人。大姐頭個性的美人，討厭小孩，性格乖戾（但對上母親玉王有時則會撒嬌），和佐竹水火不容。故事後期，現出紅色高衩泳裝並與背叛珠黃泉族的佐竹交戰，起初還佔有優勢，但最後仍敗北。在佐竹以一人之力將陪酒小姐軍團全數擺平後，還排出了由上往下看才看得出的鬼臉表情。遭到逮捕後，不知為何換回了黑色連身裙。

珠黃泉族的首領。於銀座經營「玉王俱樂部」，操京都方言。第一人稱「私」。千瑪瑪與海克森都稱她「媽媽桑」，玫瑰則稱她為「阿姨」。和藹可親的面容卻掛著深不可測的微笑，本性相當心機狡詐。曾於健康中心的宴會廳上，帶頭珠黃泉族演唱「世界の国からこんにちは」（改編歌詞版本）。當珠由良族和珠黃泉族亂鬥之時，會以「如果在這個地方打起來的話，會打擾到其他的客人」的原則，催促雙方到外頭續戰，也會和玫瑰禮貌地寒暄，甚至在小新等人逃走時，廣志遇上了客戶並交換名片，她也同樣以「交換名片是上班族的神聖儀式」之原則不對小新一行人出手，總是秉持著特有的「惡之美學」。老謀深算，泰山崩於前面不改色的「基本功」，卻能暗中行動的執行力如玉王，卻在看過「甩甩蛋蛋」那精美的人型裝置馬桶後，卻嚇得大叫。曾在雙方準備於健康中心開戰時，先吩咐大家去換衣服。故事後半，和海克森準備召喚魔人賈克時，卻搶先一步黑吃黑，不讓海克森奪走魔人的力量，隨後發生激烈爭搶。具有「鎖心術」的能力，順利破解海克森的伎倆。在向海克森要求另一顆珠珠時失敗，卻被及時趕到的刑警代子上了手銬，最終移送法辦。名字和人物設定來自中村玉緒。

本片終極敵人，移民海外的珠黃泉族子孫，是個金髮碧眼的外國人。冷靜沉著，冷酷無情如他為了達到目的，就連小寶寶小葵也絕不寬恕。曾被珠由良的母親稱為擁有「邪惡之氣的男人」，擅長格鬥術。為超能力者，能以手在地圖上完全感知目標人物的行蹤去向，以及讀取他人心思之術。擅長一邊讀心一邊作戰，就連毫無準心的代子的射擊也能輕鬆躲過，據他本人表示是在喜馬拉雅山過著野獸般的生活時修行而來的。不過，對於小新和小葵，卻無法整理其思緒脈絡來解讀他們的思考及心理，而導致頭痛。名字來自瑞克森·格雷西。而在台場新都心本部的最終決戰，對上珠由良三兄弟、佐竹、代子、廣志、美冴等七人的聯手攻勢，以讀心術游刃有餘地打倒所有人。這時候，美冴向廣志提出了以唱歌來讓腦子空白，使其讀心術無用武之地的戰術，就這樣歌唱戰術大獲成功，加上小新小葵強迫海克森讀心讓他開始頭痛欲裂，小兄妹再針對他的弱點「搔癢」直攻痛處，最終敗北（小新在珠由良本部和海克森爭奪小葵時，似乎就已發現這個弱點）。而後，魔人賈克被小新小葵不小心解除了封印跑了出來，海克森向賈克要求借用他的力量，卻因賈克的保存期限已過期而喪失魔力，計畫失敗。賈克還指出海克森和數千年前想召喚他的強大能力者，長相十分神似。統治世界計畫失敗後，將小葵抓為人質趁以要脅小新一行人，這時刑警代子因小新搗亂而開了槍，卻不偏不倚打中他的小腿使他無法繼續逃跑。但他做了最後的掙扎後，將小葵丟下大樓，小新捨身躍下，眾人及時接力合作成功救了小新小葵。海克森最後被代子制伏，與玉王、千瑪瑪等人鋃鐺入獄。

封印於人俑中的魔人。在遙遠的過去，來自珠黃泉族的強大靈力者想將其召喚藉以統治世界，最後被珠由良和珠黃泉兩族聯手阻止並封印於人俑中。故事尾聲時，被小新和小葵意外地召喚，卻因超過了保存期限（1996年12月31日）而失去魔力，再者，因其靈力長時間化為兩顆珠珠，如今則變成人妖（男大姊）。他也指出，海克森長得和數千年的強大靈力者頗為神似。事件結束後，受到三兄弟的邀請而到店裡工作。和一般想像的魔人形象相去甚遠，奇裝異服，個性屌兒郎噹、輕浮，卻和小新相當契合。另外，背上的標示刺青指出品名為魔人，內容物72公斤，能量無限，但其他營養成分不明。在《蠟筆大戰》前篇，曾與珠由良三兄弟一同登場。

漫畫家。喜好的女生類型是松隆子，興趣是欣賞馬桶座椅。在健康中心內大唱鳥羽一郎的歌曲「兄弟船」。曾向趕往珠黃泉族本部的野原一行人詢問全日本心之演歌卡拉OK大會的預選會場的位置，卻被廣志一句「誰知道－！」給痛打。此後的劇場版也數度登場，皆由原作者臼井老師親自配音。

廣志在健康中心巧遇的客戶。聲優不明。